L'alignement génétique est une méthode utilisée en bio-informatique pour comparer et analyser des séquences d'ADN, d'ARN ou de protéines afin de déterminer leur similitude et leurs relations évolutives. L'objectif de l'alignement génétique est de trouver la correspondance la plus précise entre les nucléotides (pour les séquences d'ADN ou d'ARN) ou les acides aminés (pour les séquences de protéines) des différentes séquences étudiées.